microsoft / microsoft/vscode-python-environments
How to expose environments created with Snakemake
Chưa có ai nhận issue này.
- Ngôn ngữ chính
- TypeScript
- Star
- 138
- Fork
- 62
- Merge trung bình
- 1 ngày 4 giờ
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 35
Mô tả
In [Snakemake](https://snakemake.readthedocs.io/en/stable/snakefiles/rules.html#target-rules) you normally do something like this
```python
rule my_rule:
input:
"some/input"
output:
"some/output"
conda:
"a/conda/env.yml"
script:
"some/script.py"
```
when the workflow is launched a new conda env will be created under `.snakemake/conda/xxx` where `xxx` is a hash created by snakemake (kind of a name)
Now I was hoping that doing this in `.vscode/settings.json` was enough,
```json
{
....
"python-envs.workspaceSearchPaths": [".snakemake/conda/**"],
....
}
```
But then when I e.g. open a jupyter notebook from VSCode I do not see any of those envs (neither as simple envs nor as kernels as all of them have also `ipykernel` installed)
Am I missing something?
Hướng dẫn đóng góp
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Hướng nghiên cứu
Bắt đầu với cấu hình .vscode/settings.json và tái hiện việc phát hiện bằng cách đặt python-envs.workspaceSearchPaths thành .snakemake/conda/**. Kiểm tra cách các môi trường Snakemake được tạo được xử lý khi mở một sổ tay Jupyter và liệu chúng có được cung cấp dưới dạng môi trường hay kernel hay không. Hoàn tất khi các môi trường tương ứng hiển thị trong các bộ chọn VS Code liên quan.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Đánh giá
- Công nghệ
- python
- Lĩnh vực
- tooling
- Loại issue
- Lỗi
- Độ khó
- 3/5
- Thời gian dự kiến
- 1-2 ngày
- Mức độ hoạt động
- Sôi nổi
- Độ rõ ràng
- Khá rõ ràng
- Mức phù hợp với người mới
- 66/100