microsoft / microsoft/vscode-python-environments
How to expose environments created with Snakemake
Nessuno ha ancora preso questa issue.
- Lingua principale
- TypeScript
- Stelle
- 138
- Fork
- 62
- Merge medio
- 1g 4h
- PR unite (30g)
- 35
Descrizione
In [Snakemake](https://snakemake.readthedocs.io/en/stable/snakefiles/rules.html#target-rules) you normally do something like this
```python
rule my_rule:
input:
"some/input"
output:
"some/output"
conda:
"a/conda/env.yml"
script:
"some/script.py"
```
when the workflow is launched a new conda env will be created under `.snakemake/conda/xxx` where `xxx` is a hash created by snakemake (kind of a name)
Now I was hoping that doing this in `.vscode/settings.json` was enough,
```json
{
....
"python-envs.workspaceSearchPaths": [".snakemake/conda/**"],
....
}
```
But then when I e.g. open a jupyter notebook from VSCode I do not see any of those envs (neither as simple envs nor as kernels as all of them have also `ipykernel` installed)
Am I missing something?
Guida per i contributori
Apri la guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
Direzione di ricerca
Inizia dalla configurazione di .vscode/settings.json e riproduci il rilevamento impostando python-envs.workspaceSearchPaths su .snakemake/conda/**. Verifica come vengono gestiti gli ambienti Snakemake generati quando si apre un notebook Jupyter e se vengono offerti come ambienti o kernel. L’attività è completata quando gli ambienti corrispondenti sono visibili nei selettori pertinenti di VS Code.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Valutazione
- Stack tecnologico
- python
- Ambito
- tooling
- Tipo di issue
- Bug
- Difficoltà
- 3/5
- Tempo stimato
- 1-2 giorni
- Stato di attività
- Attiva
- Chiarezza
- Abbastanza chiara
- Idoneità per principianti
- 66/100