microsoft / microsoft/vscode-python-environments
How to expose environments created with Snakemake
- Lenguaje dominante
- TypeScript
- Estrellas
- 138
- Forks
- 62
- Merge medio
- 1 d 4 h
- PR fusionados (30 d)
- 35
Descripción
In [Snakemake](https://snakemake.readthedocs.io/en/stable/snakefiles/rules.html#target-rules) you normally do something like this
```python
rule my_rule:
input:
"some/input"
output:
"some/output"
conda:
"a/conda/env.yml"
script:
"some/script.py"
```
when the workflow is launched a new conda env will be created under `.snakemake/conda/xxx` where `xxx` is a hash created by snakemake (kind of a name)
Now I was hoping that doing this in `.vscode/settings.json` was enough,
```json
{
....
"python-envs.workspaceSearchPaths": [".snakemake/conda/**"],
....
}
```
But then when I e.g. open a jupyter notebook from VSCode I do not see any of those envs (neither as simple envs nor as kernels as all of them have also `ipykernel` installed)
Am I missing something?
Guía de contribución
Línea de trabajo
Comienza con la configuración de .vscode/settings.json y reproduce el descubrimiento estableciendo python-envs.workspaceSearchPaths en .snakemake/conda/**. Comprueba cómo se gestionan los entornos de Snakemake generados al abrir un cuaderno de Jupyter y si se ofrecen como entornos o kernels. La tarea está terminada cuando los entornos correspondientes son visibles en los selectores relevantes de VS Code.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Evaluación
- Stack tecnológico
- python
- Área
- tooling
- Tipo de issue
- Error
- Dificultad
- 3/5
- Tiempo estimado
- 1-2 días
- Estado de actividad
- Activo
- Claridad
- Bastante claro
- Aptitud para principiantes
- 66/100