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AllenCell
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vole-core
core rendering canvas and data loading services for Vol-E volume viewer
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agave
High quality visualization for volumetric image data
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Part 1 of Allen Cell and Structure Segmenter: classic image segmentation workflow
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cvapipe_analysis
Analysis of data produced by cvapipe for the variance paper
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A plugin that enables image segmentation provided by Allen Institute for Cell Science
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scripts and API for running Deep Learning models from segmenter
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Benchmarking different methods for extracting unsupervised representations from images
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Napari plugin for ml segmentation
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endothelial-pipeline
Dynamics of ML-based morphological features indicate a shear stress-dependent bifurcation of hiPSC-derived endothelial cell states
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cell-feature-explorer
Plot and explore data that is linked to images, with an embedded viewer
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EMT_data_analysis
This repo contains code for EMT deliverable data analysis and has dependencies associated with output from EMT_image_analysis repo.
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camera-alignment-core
Core algorithms for alignment of two-camera microscopy imagery
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Frontend interface for cellPACK
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Cell catalog 2.0
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improve ROI setting Abierto
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linux release bundle Abierto
AllenCell/agave#46 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados ·
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AllenCell/agave#47 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados ·
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AllenCell/agave#48 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados ·
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log to gui window Abierto
AllenCell/agave#49 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados ·
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AllenCell/agave#51 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados ·
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AllenCell/agave#52 · 2 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados ·
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skylight with environment map Abierto
AllenCell/agave#53 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados ·
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downsample data at load time Abierto
AllenCell/agave#54 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados ·
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allow channel masking Abierto
AllenCell/agave#58 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados ·
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AllenCell/agave#59 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados ·
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AllenCell/agave#60 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados ·
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AllenCell/agave#61 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados ·
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AllenCell/vole-core#155 · 1 comentario · 0 reacciones · 1 asignado ·
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Don't load disabled channels Abierto
AllenCell/vole-core#158 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado ·
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use setChannelOptions more Abiertomilestone candidate Tech Debt
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AllenCell/vole-core#235 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados ·
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AllenCell/vole-core#363 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados ·
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Prefetch/cache controls Abiertodata-loading
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Add automated import sorting Abierto
AllenCell/vole-core#273 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados ·
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AllenCell/vole-core#292 · 2 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados ·
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AllenCell/vole-core#293 · 3 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados ·
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AllenCell/vole-core#303 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados ·
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Transfer function internals Abierto
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AllenCell/vole-core#310 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados ·
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"Profile curve" tool Abiertomilestone candidate
AllenCell/vole-core#311 · 2 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados ·
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AllenCell/vole-core#322 · 2 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados ·
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AllenCell/vole-core#330 · 2 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados ·
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AllenCell/vole-core#337 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados ·
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AllenCell/vole-core#339 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados ·
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AllenCell/vole-core#358 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados ·
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