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core rendering canvas and data loading services for Vol-E volume viewer

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High quality visualization for volumetric image data

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Part 1 of Allen Cell and Structure Segmenter: classic image segmentation workflow

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Analysis of data produced by cvapipe for the variance paper

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A plugin that enables image segmentation provided by Allen Institute for Cell Science

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scripts and API for running Deep Learning models from segmenter

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Benchmarking different methods for extracting unsupervised representations from images

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Napari plugin for ml segmentation

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Dynamics of ML-based morphological features indicate a shear stress-dependent bifurcation of hiPSC-derived endothelial cell states

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Plot and explore data that is linked to images, with an embedded viewer

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This repo contains code for EMT deliverable data analysis and has dependencies associated with output from EMT_image_analysis repo.

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Cell catalog 2.0

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オープンすべて

オープンの issue を 465 件索引しました

Size measurement オープン

ux

AllenCell/vole-core#380 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Highlight region of interest オープン

milestone candidate

AllenCell/vole-core#381 · コメント 3 件 · リアクション 1 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
update colorize mode オープン

bug Tech Debt

AllenCell/vole-core#383 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Switch to `WebGPURenderer` オープン

AllenCell/vole-core#401 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Render to pick buffer in main mesh pass オープン

Tech Debt

AllenCell/vole-core#404 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Remove all `three` types from `vole-core` API オープン

Tech Debt

AllenCell/vole-core#409 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Update `ColorizeFeature` type to remove `three` types. オープン

Tech Debt

AllenCell/vole-core#410 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Remove direct external access to `IDrawableObject`s オープン

Tech Debt

AllenCell/vole-core#411 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Make `VolumeRenderImpl` a subtype of `IDrawableObject` オープン

Tech Debt

AllenCell/vole-core#412 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Add a class to move responsibility for `IDrawableObjects` out of `VolumeDrawable` オープン

Tech Debt

AllenCell/vole-core#413 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Move the pick buffer out of `PickVolume` オープン

Tech Debt

AllenCell/vole-core#414 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
switch to BSD-3 license オープン

AllenCell/vole-core#417 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
add typedoc to package.json オープン

milestone candidate

AllenCell/vole-core#433 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
`vole-core` v5 major release オープン

enhancement

AllenCell/vole-core#462 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Document all EventDispatchers オープン

AllenCell/vole-core#471 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
toolbar icons オープン

UX

AllenCell/agave#75 · コメント 4 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
wall and floor planes オープン

UX

AllenCell/agave#76 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Logo for AGAVE オープン

UX

AllenCell/agave#81 · コメント 4 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
load data asynchronously and incrementally オープン

AllenCell/agave#84 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
zoom with scroll wheel オープン

AllenCell/agave#91 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
signed app for windows and macos オープン

AllenCell/agave#93 · コメント 0 件 · リアクション 1 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
round corners of render preview window オープン

AllenCell/agave#96 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Loading settings: make channels list smaller オープン

AllenCell/agave#98 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
render dialog change button appearance contextually オープン

AllenCell/agave#100 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
rewrite web client オープン

AllenCell/agave#111 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
option to output mp4 directly instead of pngs オープン

AllenCell/agave#118 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Make top-level control groupings collapsible オープン

needs-spec UX

AllenCell/agave#133 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Clean up Camera panel オープン

needs-spec UX

AllenCell/agave#134 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Reorganize and clean up input fields on main screen オープン

UX

AllenCell/agave#135 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
Onboarding / app tour オープン

UX

AllenCell/agave#136 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Undo / Redo オープン

AllenCell/agave#137 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
undo feature: ui design オープン

UX

AllenCell/agave#143 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
internals: refactor font lazy init so font can be a shared resource オープン

AllenCell/agave#162 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
internals: font initialization TODO オープン

AllenCell/agave#163 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
numeric input sliders: allow out-of-range behavior オープン

AllenCell/agave#166 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
check for updates オープン

AllenCell/agave#185 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
keyframing オープン

AllenCell/agave#196 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
try c++20 オープン

AllenCell/agave#227 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
reset Volume Scale オープン

AllenCell/agave#244 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
refactor: graphics abstraction layer オープン

AllenCell/agave#249 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
refactor: object properties layer オープン

AllenCell/agave#250 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
animation オープン

AllenCell/agave#252 · コメント 2 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
make sure python client works with all non-endoflife python versions up to 3.13 オープン

AllenCell/agave#272 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Allow customising ray step size in render window オープン

AllenCell/agave#275 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
gpu memory leak when loading new image オープン

bug

AllenCell/agave#276 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
tiffs generated from tifffile with imagej metadata loading incorrectly オープン

bug

AllenCell/agave#287 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
internals: gesture graphics improvements オープン

AllenCell/agave#294 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Option to limit number of iterations オープン

enhancement

AllenCell/agave#296 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
the appearance panel has lots of scrolling going on オープン

UX

AllenCell/agave#315 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Render dialog can prepopulate better オープン

UX

AllenCell/agave#316 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引

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