scverse / scverse/spatialdata-tutorials

Update Xenium dataset

オープン
#110 コメント 0 件 リアクション 0 件 担当者 0 名 GitHub で見る

まだ誰も着手していません。

主要言語
Jupyter Notebook
スター
67
フォーク
26
平均マージ
4分
マージ済み PR(30日)
1

説明

The Xenium notebook is using a previous dataset (for XOA 2.0). We should consider using on the following recent datasets, recommended by the 10x team:

In alternative we could use the preview data for the 5K panel:

Or even better,

  • wait until a stable version of the 5K panel data is released and use that.

コントリビューションガイド

このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません

はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

調査の方向性

Xenium notebook を見つけ、現在の XOA 2.0 dataset がどのように参照されているかを確認します。リンクされている 10x datasets を比較し、そのうちの 1 つを使用するか、安定した 5K panel data を待つかを判断します。完了条件は、notebook が選択した dataset を使用し、引き続き正常に実行できることです。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

評価

技術スタック
jupyter-notebook
領域
data, documentation
issue の種類
ドキュメント
難易度
3/5
見積もり時間
1〜2日
活発さ
停滞
明瞭さ
おおむね明確
初心者へのやさしさ
35/100

新しい issue をメールで受け取る

初心者向けの GitHub issue を短くまとめたダイジェスト。