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Update Xenium dataset
オープン
まだ誰も着手していません。
- 主要言語
- Jupyter Notebook
- スター
- 67
- フォーク
- 26
- 平均マージ
- 4分
- マージ済み PR(30日)
- 1
説明
The Xenium notebook is using a previous dataset (for XOA 2.0). We should consider using on the following recent datasets, recommended by the 10x team:
- FFPE Human Pancreas with Xenium Multimodal Cell Segmentation
- Fresh Frozen Mouse Colon with Xenium Multimodal Cell Segmentation
In alternative we could use the preview data for the 5K panel:
Or even better,
- wait until a stable version of the 5K panel data is released and use that.
コントリビューションガイド
このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
調査の方向性
Xenium notebook を見つけ、現在の XOA 2.0 dataset がどのように参照されているかを確認します。リンクされている 10x datasets を比較し、そのうちの 1 つを使用するか、安定した 5K panel data を待つかを判断します。完了条件は、notebook が選択した dataset を使用し、引き続き正常に実行できることです。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
評価
- 技術スタック
- jupyter-notebook
- 領域
- data, documentation
- issue の種類
- ドキュメント
- 難易度
- 3/5
- 見積もり時間
- 1〜2日
- 活発さ
- 停滞
- 明瞭さ
- おおむね明確
- 初心者へのやさしさ
- 35/100