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Update Xenium dataset
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- Langage dominant
- Jupyter Notebook
- Étoiles
- 67
- Forks
- 26
- Merge moyen
- 4 min
- PR mergées (30 j)
- 1
Description
The Xenium notebook is using a previous dataset (for XOA 2.0). We should consider using on the following recent datasets, recommended by the 10x team:
- FFPE Human Pancreas with Xenium Multimodal Cell Segmentation
- Fresh Frozen Mouse Colon with Xenium Multimodal Cell Segmentation
In alternative we could use the preview data for the 5K panel:
Or even better,
- wait until a stable version of the 5K panel data is released and use that.
Guide de contribution
Aucun guide de contribution indexé pour ce dépôt
Par où commencer
- Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
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Piste de recherche
Repérez le notebook Xenium et examinez comment l’ensemble de données XOA 2.0 actuel est référencé. Comparez les ensembles de données 10x liés et déterminez s’il faut en utiliser un ou attendre des données stables du panel 5K ; la tâche est terminée lorsque le notebook utilise l’ensemble de données sélectionné et s’exécute toujours correctement.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Évaluation
- Stack technique
- jupyter-notebook
- Domaine
- data, documentation
- Type d'issue
- Documentation
- Difficulté
- 3/5
- Temps estimé
- 1-2 jours
- Activité
- À l'abandon
- Clarté
- Plutôt claire
- Accessibilité débutants
- 35/100