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Update Xenium dataset
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- Lenguaje dominante
- Jupyter Notebook
- Estrellas
- 67
- Forks
- 26
- Merge medio
- 4 min
- PR fusionados (30 d)
- 1
Descripción
The Xenium notebook is using a previous dataset (for XOA 2.0). We should consider using on the following recent datasets, recommended by the 10x team:
- FFPE Human Pancreas with Xenium Multimodal Cell Segmentation
- Fresh Frozen Mouse Colon with Xenium Multimodal Cell Segmentation
In alternative we could use the preview data for the 5K panel:
Or even better,
- wait until a stable version of the 5K panel data is released and use that.
Guía de contribución
No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
Línea de trabajo
Localiza el notebook de Xenium e inspecciona cómo se referencia actualmente el conjunto de datos XOA 2.0. Compara los conjuntos de datos 10x vinculados y determina si se debe usar uno de ellos o esperar a que haya datos estables del panel 5K; se considera terminado cuando el notebook usa el conjunto de datos seleccionado y sigue ejecutándose correctamente.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Evaluación
- Stack tecnológico
- jupyter-notebook
- Área
- data, documentation
- Tipo de issue
- Documentación
- Dificultad
- 3/5
- Tiempo estimado
- 1-2 días
- Estado de actividad
- Estancado
- Claridad
- Bastante claro
- Aptitud para principiantes
- 35/100