scverse / scverse/spatialdata-tutorials

Update Xenium dataset

未关闭
#110 0 条评论 0 个 reaction 已指派 0 人 在 GitHub 查看

还没有人认领这个 Issue。

主要语言
Jupyter Notebook
星标
67
派生
26
平均合并
4 分钟
30 天内合并 PR
1

描述

The Xenium notebook is using a previous dataset (for XOA 2.0). We should consider using on the following recent datasets, recommended by the 10x team:

In alternative we could use the preview data for the 5K panel:

Or even better,

  • wait until a stable version of the 5K panel data is released and use that.

贡献指南

这个仓库没有索引到贡献指南

从这里开始

  1. 先读完整个 Issue,再读项目的贡献指南。
  2. 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
  3. Fork 仓库,在一个分支上完成修改。
  4. 提交 Pull Request,并在描述里引用这个 Issue 编号。

调研方向

找到 Xenium notebook,并检查当前如何引用 XOA 2.0 dataset。比较已链接的 10x datasets,并确定应使用其中一个,还是等待稳定的 5K panel data;完成的标准是 notebook 使用选定的 dataset 并且仍能成功运行。

由索引模型根据 Issue 内容生成。

评估

技术栈
jupyter-notebook
领域
data, documentation
Issue 类型
文档
难度
3/5
预计耗时
1-2 天
活跃度
停滞
描述清晰度
基本清楚
新手友好度
35/100

把新 issue 发到你的邮箱

精选适合新手参与的 GitHub issue 摘要。