Experiment manager breaks 3D view

To reproduce:
- Load tutorial 1, e.g. on OSB
- View default network in 3D, e.g.

- Add an experiment, e.g. iterating over the number of cells:

- Run the experiment
- Load one of the trials, e.g. 3 cells
- View in 3D:

- So correct number of cells, but morphology squashed. Same happenned with other experiments changing other parameters

Any sign of this before @ddelpiano @salvadord?

チュートリアル 1 の問題を、デフォルトネットワークを 3D で表示し、細胞数を変更する実験を実行して、3 cells のような試行を開くことで再現します。まず、実験マネージャーを 3D ビューまでたどり、試行のジオメトリをデフォルトビューと比較します。実験の試行で、形態が押しつぶされることなく正しい細胞数が表示されれば完了です。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。