MetaCell / MetaCell/NetPyNE-UI

Experiment manager breaks 3D view

Aberta
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Ninguém assumiu esta issue ainda.

Linguagem predominante
JavaScript
Estrelas
23
Forks
10
Métricas de merge de PRs
Nenhum PR com merge em 30d

Descrição

To reproduce:
- Load tutorial 1, e.g. on OSB
- View default network in 3D, e.g.
![Screenshot from 2023-04-18 16-20-50](https://user-images.githubusercontent.com/1556687/232824525-ef93487f-cd90-4b32-9760-fb3f1265f667.png)

- Add an experiment, e.g. iterating over the number of cells:
![Screenshot from 2023-04-18 16-22-23](https://user-images.githubusercontent.com/1556687/232824914-4d647a25-b116-49fc-aa20-7dc9d45cd098.png)

- Run the experiment
- Load one of the trials, e.g. 3 cells
- View in 3D:
![Screenshot from 2023-04-18 16-23-19](https://user-images.githubusercontent.com/1556687/232825140-322a55b2-97cf-42ba-adb9-e12a142479e3.png)

- So correct number of cells, but morphology squashed. Same happenned with other experiments changing other parameters

Any sign of this before @ddelpiano @salvadord?

Guia de contribuição

Nenhum guia de contribuição indexado para este repositório

Primeiros passos

  1. Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
  2. Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
  3. Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
  4. Abra um pull request que referencie o número da issue.

Direção de pesquisa

Reproduza o problema com o tutorial 1 visualizando a rede padrão em 3D, executando um experimento que altere o número de células e abrindo um ensaio como 3 células. Comece rastreando o gerenciador de experimentos até a visualização 3D e compare a geometria do ensaio com a visualização padrão. Está concluído quando os ensaios do experimento exibirem a contagem correta de células sem uma morfologia achatada.

Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.

Avaliação

Stack de tecnologia
javascript
Domínio
frontend
Tipo de issue
Bug
Dificuldade
3/5
Tempo estimado
1-2 dias
Status de atividade
Estagnada
Clareza
Razoavelmente clara
Facilidade para iniciantes
45/100

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