blekhmanlab / blekhmanlab/MicroBioMap

Document custom ordination process

Đang mở Phù hợp với người mới
#29 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub
documentation
Ngôn ngữ chính
R
Star
17
Fork
3
Chỉ số merge pull request
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Mô tả

We have all the components (rarefaction, consolidation at family level, `prcomp` calls to get loadings, etc) needed to make a nice little helper function that does all the work, but those are also the steps that a user may want to do differently for their ordination. We don't have to come up with every possible parameter ahead of time for a helper function if we just provide an example script highlighting areas someone may want to tweak.

Hướng dẫn đóng góp

Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu bằng cách xác định các lệnh gọi rarefaction, family-level consolidation và prcomp hiện có trong package R, sau đó xem lại mọi ví dụ hoặc tài liệu hiện tại. Thêm một script ví dụ trình bày workflow ordination và các bước mà người dùng có thể muốn sửa đổi; được xem là hoàn thành khi script dễ hiểu và có thể tái lập.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Đánh giá

Công nghệ
r
Lĩnh vực
bioinformatics, documentation
Loại issue
Tài liệu
Độ khó
2/5
Thời gian dự kiến
1-3 giờ
Mức độ hoạt động
Ít trao đổi
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức phù hợp với người mới
68/100

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.