blekhmanlab / blekhmanlab/MicroBioMap

Document custom ordination process

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documentation
Lingua principale
R
Stelle
17
Fork
3
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Descrizione

We have all the components (rarefaction, consolidation at family level, `prcomp` calls to get loadings, etc) needed to make a nice little helper function that does all the work, but those are also the steps that a user may want to do differently for their ordination. We don't have to come up with every possible parameter ahead of time for a helper function if we just provide an example script highlighting areas someone may want to tweak.

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Direzione di ricerca

Inizia individuando le chiamate esistenti a rarefaction, family-level consolidation e prcomp nel package R, quindi esamina gli eventuali esempi o la documentazione attuali. Aggiungi uno script di esempio che mostri il workflow di ordinamento e i passaggi che gli utenti potrebbero voler modificare; il lavoro è completato quando lo script è comprensibile e riproducibile.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Valutazione

Stack tecnologico
r
Ambito
bioinformatics, documentation
Tipo di issue
Documentazione
Difficoltà
2/5
Tempo stimato
1-3 ore
Stato di attività
Tranquilla
Chiarezza
Abbastanza chiara
Idoneità per principianti
68/100

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