blekhmanlab / blekhmanlab/MicroBioMap
Document custom ordination process
- Lingua principale
- R
- Stelle
- 17
- Fork
- 3
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Descrizione
We have all the components (rarefaction, consolidation at family level, `prcomp` calls to get loadings, etc) needed to make a nice little helper function that does all the work, but those are also the steps that a user may want to do differently for their ordination. We don't have to come up with every possible parameter ahead of time for a helper function if we just provide an example script highlighting areas someone may want to tweak.
Guida per i contributori
Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository
Direzione di ricerca
Inizia individuando le chiamate esistenti a rarefaction, family-level consolidation e prcomp nel package R, quindi esamina gli eventuali esempi o la documentazione attuali. Aggiungi uno script di esempio che mostri il workflow di ordinamento e i passaggi che gli utenti potrebbero voler modificare; il lavoro è completato quando lo script è comprensibile e riproducibile.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Valutazione
- Stack tecnologico
- r
- Ambito
- bioinformatics, documentation
- Tipo di issue
- Documentazione
- Difficoltà
- 2/5
- Tempo stimato
- 1-3 ore
- Stato di attività
- Tranquilla
- Chiarezza
- Abbastanza chiara
- Idoneità per principianti
- 68/100