blekhmanlab / blekhmanlab/MicroBioMap
Document custom ordination process
- Vorherrschende Sprache
- R
- Sterne
- 17
- Forks
- 3
- PR-Merge-Kennzahlen
- Keine gemergten PRs in 30 T.
Beschreibung
We have all the components (rarefaction, consolidation at family level, `prcomp` calls to get loadings, etc) needed to make a nice little helper function that does all the work, but those are also the steps that a user may want to do differently for their ordination. We don't have to come up with every possible parameter ahead of time for a helper function if we just provide an example script highlighting areas someone may want to tweak.
Beitragsleitfaden
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Rechercherichtung
Beginnen Sie damit, die vorhandenen Aufrufe für rarefaction, family-level consolidation und prcomp im R-Paket zu finden, und prüfen Sie anschließend alle aktuellen Beispiele oder Dokumentationen. Fügen Sie ein Beispielskript hinzu, das den Ordinations-Workflow und die Schritte zeigt, die Benutzer möglicherweise ändern möchten; als erledigt gilt die Aufgabe, wenn das Skript verständlich und reproduzierbar ist.
Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.
Bewertung
- Tech-Stack
- r
- Bereich
- bioinformatics, documentation
- Issue-Typ
- Dokumentation
- Schwierigkeit
- 2/5
- Geschätzter Aufwand
- 1-3 Stunden
- Aktivitätsstatus
- Ruhig
- Klarheit
- Größtenteils klar
- Anfängerfreundlichkeit
- 68/100