blekhmanlab / blekhmanlab/MicroBioMap

Document custom ordination process

Offen Anfängerfreundlich
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documentation
Vorherrschende Sprache
R
Sterne
17
Forks
3
PR-Merge-Kennzahlen
Keine gemergten PRs in 30 T.

Beschreibung

We have all the components (rarefaction, consolidation at family level, `prcomp` calls to get loadings, etc) needed to make a nice little helper function that does all the work, but those are also the steps that a user may want to do differently for their ordination. We don't have to come up with every possible parameter ahead of time for a helper function if we just provide an example script highlighting areas someone may want to tweak.

Beitragsleitfaden

Für dieses Repository ist kein Beitragsleitfaden indexiert

Rechercherichtung

Beginnen Sie damit, die vorhandenen Aufrufe für rarefaction, family-level consolidation und prcomp im R-Paket zu finden, und prüfen Sie anschließend alle aktuellen Beispiele oder Dokumentationen. Fügen Sie ein Beispielskript hinzu, das den Ordinations-Workflow und die Schritte zeigt, die Benutzer möglicherweise ändern möchten; als erledigt gilt die Aufgabe, wenn das Skript verständlich und reproduzierbar ist.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Bewertung

Tech-Stack
r
Bereich
bioinformatics, documentation
Issue-Typ
Dokumentation
Schwierigkeit
2/5
Geschätzter Aufwand
1-3 Stunden
Aktivitätsstatus
Ruhig
Klarheit
Größtenteils klar
Anfängerfreundlichkeit
68/100

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