blekhmanlab / blekhmanlab/MicroBioMap

Document custom ordination process

Ouverte Adaptée aux débutants
#29 0 commentaires 0 réactions 0 personnes assignées Voir sur GitHub
documentation
Langage dominant
R
Étoiles
17
Forks
3
Métriques de merge des PR
Aucune PR mergée en 30 j

Description

We have all the components (rarefaction, consolidation at family level, `prcomp` calls to get loadings, etc) needed to make a nice little helper function that does all the work, but those are also the steps that a user may want to do differently for their ordination. We don't have to come up with every possible parameter ahead of time for a helper function if we just provide an example script highlighting areas someone may want to tweak.

Guide de contribution

Aucun guide de contribution indexé pour ce dépôt

Piste de recherche

Commencez par localiser les appels existants à rarefaction, family-level consolidation et prcomp dans le package R, puis examinez les exemples ou la documentation actuels. Ajoutez un script d’exemple montrant le workflow d’ordination et les étapes que les utilisateurs pourraient vouloir modifier ; le travail sera considéré comme terminé lorsque le script sera compréhensible et reproductible.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Évaluation

Stack technique
r
Domaine
bioinformatics, documentation
Type d'issue
Documentation
Difficulté
2/5
Temps estimé
1-3 heures
Activité
Calme
Clarté
Plutôt claire
Accessibilité débutants
68/100

Recevez les nouvelles issues par e-mail

Un résumé court des issues GitHub adaptées aux débutants.