blekhmanlab / blekhmanlab/MicroBioMap
Document custom ordination process
- Langage dominant
- R
- Étoiles
- 17
- Forks
- 3
- Métriques de merge des PR
- Aucune PR mergée en 30 j
Description
We have all the components (rarefaction, consolidation at family level, `prcomp` calls to get loadings, etc) needed to make a nice little helper function that does all the work, but those are also the steps that a user may want to do differently for their ordination. We don't have to come up with every possible parameter ahead of time for a helper function if we just provide an example script highlighting areas someone may want to tweak.
Guide de contribution
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Piste de recherche
Commencez par localiser les appels existants à rarefaction, family-level consolidation et prcomp dans le package R, puis examinez les exemples ou la documentation actuels. Ajoutez un script d’exemple montrant le workflow d’ordination et les étapes que les utilisateurs pourraient vouloir modifier ; le travail sera considéré comme terminé lorsque le script sera compréhensible et reproductible.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Évaluation
- Stack technique
- r
- Domaine
- bioinformatics, documentation
- Type d'issue
- Documentation
- Difficulté
- 2/5
- Temps estimé
- 1-3 heures
- Activité
- Calme
- Clarté
- Plutôt claire
- Accessibilité débutants
- 68/100