blekhmanlab / blekhmanlab/MicroBioMap
Document custom ordination process
- Lenguaje dominante
- R
- Estrellas
- 17
- Forks
- 3
- Métricas de merge de PR
- Sin PR fusionados en 30 d
Descripción
We have all the components (rarefaction, consolidation at family level, `prcomp` calls to get loadings, etc) needed to make a nice little helper function that does all the work, but those are also the steps that a user may want to do differently for their ordination. We don't have to come up with every possible parameter ahead of time for a helper function if we just provide an example script highlighting areas someone may want to tweak.
Guía de contribución
No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio
Línea de trabajo
Comienza localizando las llamadas existentes a rarefaction, family-level consolidation y prcomp en el paquete de R, y revisa después cualquier ejemplo o documentación actuales. Añade un script de ejemplo que muestre el flujo de trabajo de ordenación y los pasos que los usuarios quizá quieran modificar; se considerará terminado cuando el script sea comprensible y reproducible.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Evaluación
- Stack tecnológico
- r
- Área
- bioinformatics, documentation
- Tipo de issue
- Documentación
- Dificultad
- 2/5
- Tiempo estimado
- 1-3 horas
- Estado de actividad
- Tranquilo
- Claridad
- Bastante claro
- Aptitud para principiantes
- 68/100