[Java] Handle Flight Tests to gracefully shutdown.

### Describe the bug, including details regarding any error messages, version, and platform.

We have been experiencing a few flaky tests in Flight. And recently this was tracked in another PR https://github.com/apache/arrow/pull/43551#issuecomment-2328024081.

The root cause could be the issue discussed here. Shutting down the servers gracefully in order to release resources is necessary to avoid this flakiness in the tests.

### Component(s)

Java

まず、Flight の不安定なテストレポートと Apache Arrow PR 43551 にリンクされている議論を確認します。リソースを保持している Flight テストサーバーを特定し、正常なシャットダウンをどのように調整すべきかを判断します。サーバーが確実にリソースを解放し、報告されたテストの不安定性が解消されれば完了です。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。