DeepGraphLearning / DeepGraphLearning/PerturbDiff
Inference
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- 主要语言
- Python
- 星标
- 63
- 派生
- 10
- PR 合并指标
- 30 天内没有已合并 PR
描述
Thanks for the work!
How can I use your model finetuned on tahoe for instance to predict the gene expression matrix of cells perturbed by a drug given my own gene expression matrix of control cells? That would a very useful notebook to have :).
Raf
贡献指南
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从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
调研方向
首先定位在 Tahoe 上微调的模型和任何现有的推理入口点，然后检查控制基因表达矩阵和药物扰动是如何表示的。定义一个 notebook，接受用户的控制矩阵，应用模型，并演示对受扰动细胞表达矩阵的预测。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
评估
- 技术栈
- python
- 领域
- bioinformatics, machine-learning
- Issue 类型
- 功能
- 难度
- 4/5
- 预计耗时
- 3-5 天
- 活跃度
- 活跃
- 描述清晰度
- 需要澄清
- 新手友好度
- 45/100