DeepGraphLearning / DeepGraphLearning/PerturbDiff
Inference
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- Langage dominant
- Python
- Étoiles
- 63
- Forks
- 10
- Métriques de merge des PR
- Aucune PR mergée en 30 j
Description
Thanks for the work!
How can I use your model finetuned on tahoe for instance to predict the gene expression matrix of cells perturbed by a drug given my own gene expression matrix of control cells? That would a very useful notebook to have :).
Raf
Guide de contribution
Aucun guide de contribution indexé pour ce dépôt
Par où commencer
- Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
- Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
- Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
- Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.
Piste de recherche
Commencez par localiser le modèle affiné sur Tahoe et tout point d’entrée d’inférence existant, puis examinez comment sont représentées les matrices de contrôle de l’expression génique et les perturbations médicamenteuses. Définissez un notebook qui accepte la matrice de contrôle d’un utilisateur, applique le modèle et montre la prédiction de la matrice d’expression des cellules perturbées.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Évaluation
- Stack technique
- python
- Domaine
- bioinformatics, machine-learning
- Type d'issue
- Fonctionnalité
- Difficulté
- 4/5
- Temps estimé
- 3-5 jours
- Activité
- Active
- Clarté
- À clarifier
- Accessibilité débutants
- 45/100