Proprietario
AllenCell
20 repository indicizzati · Vedi su GitHub
-
vole-core
core rendering canvas and data loading services for Vol-E volume viewer
TypeScript · 106 stelle
-
agave
High quality visualization for volumetric image data
C++ · 62 stelle
-
Python · 32 stelle
-
Python · 32 stelle
-
aics-segmentation
Part 1 of Allen Cell and Structure Segmenter: classic image segmentation workflow
Jupyter Notebook · 26 stelle
-
cvapipe_analysis
Analysis of data produced by cvapipe for the variance paper
Jupyter Notebook · 24 stelle
-
Python · 24 stelle
-
napari-allencell-segmenter
A plugin that enables image segmentation provided by Allen Institute for Cell Science
Python · 20 stelle
-
segmenter_model_zoo
scripts and API for running Deep Learning models from segmenter
Jupyter Notebook · 10 stelle
-
Python · 7 stelle
-
benchmarking_representations
Benchmarking different methods for extracting unsupervised representations from images
Python · 7 stelle
-
allencell-segmenter-ml
Napari plugin for ml segmentation
Python · 5 stelle
-
endothelial-pipeline
Dynamics of ML-based morphological features indicate a shear stress-dependent bifurcation of hiPSC-derived endothelial cell states
Python · 2 stelle
-
cell-feature-explorer
Plot and explore data that is linked to images, with an embedded viewer
TypeScript · 2 stelle
-
EMT_data_analysis
This repo contains code for EMT deliverable data analysis and has dependencies associated with output from EMT_image_analysis repo.
Python · 1 stella
-
Python · 0 stelle
-
camera-alignment-core
Core algorithms for alignment of two-camera microscopy imagery
Python · 0 stelle
-
cellpack-client
Frontend interface for cellPACK
TypeScript · 0 stelle
-
cell-catalog
Cell catalog 2.0
TypeScript · 0 stelle
-
TypeScript · 0 stelle
-
improve ROI setting Aperta
AllenCell/agave#44 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
AllenCell/agave#45 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
linux release bundle Aperta
AllenCell/agave#46 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
AllenCell/agave#47 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
AllenCell/agave#48 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
log to gui window Aperta
AllenCell/agave#49 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
AllenCell/agave#51 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
AllenCell/agave#52 · 2 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
AllenCell/agave#53 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
downsample data at load time Aperta
AllenCell/agave#54 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
allow channel masking Aperta
AllenCell/agave#58 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
AllenCell/agave#59 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
AllenCell/agave#60 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
AllenCell/agave#61 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
AllenCell/agave#74 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario ·
-
Tech Debt
AllenCell/vole-core#90 · 3 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario ·
-
data-loading
AllenCell/vole-core#115 · 2 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario ·
-
AllenCell/vole-core#120 · 3 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
AllenCell/vole-core#121 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
data-loading
AllenCell/vole-core#155 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario ·
-
Don't load disabled channels Aperta
AllenCell/vole-core#158 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario ·
-
use setChannelOptions more Apertamilestone candidate Tech Debt
AllenCell/vole-core#159 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
bug
AllenCell/vole-core#200 · 2 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
AllenCell/vole-core#214 · 3 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
data-loading
AllenCell/vole-core#217 · 4 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario ·
-
bug
AllenCell/vole-core#218 · 2 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario ·
-
bug
AllenCell/vole-core#235 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
bug
AllenCell/vole-core#363 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
Prefetch/cache controls Apertadata-loading
AllenCell/vole-core#248 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
Record MP4 video Apertaenhancement
AllenCell/vole-core#249 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
data-loading Tech Debt
AllenCell/vole-core#250 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
Tech Debt
AllenCell/vole-core#254 · 3 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
Tech Debt
AllenCell/vole-core#258 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
AllenCell/vole-core#271 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
Add automated import sorting Aperta
AllenCell/vole-core#273 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
bug
AllenCell/vole-core#292 · 2 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
bug
AllenCell/vole-core#293 · 3 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
Tech Debt
AllenCell/vole-core#303 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
Transfer function internals Aperta
AllenCell/vole-core#308 · 2 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
AllenCell/vole-core#309 · 3 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
milestone candidate ux
AllenCell/vole-core#310 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
"Profile curve" tool Apertamilestone candidate
AllenCell/vole-core#311 · 2 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
enhancement
AllenCell/vole-core#322 · 2 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
bug
AllenCell/vole-core#330 · 2 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
AllenCell/vole-core#337 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
enhancement
AllenCell/vole-core#339 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
bug
AllenCell/vole-core#341 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
bug
AllenCell/vole-core#357 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
enhancement
AllenCell/vole-core#358 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari ·
-
AllenCell/vole-core#365 · 2 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari ·