Refactor Xenium + Visium paths and use better names

• all the paths used in notebooks 00_xenium_and_visium.ipynb, 01_xenium_and_visium.ipynb and 02_xenium_and_visium.ipynb should be placed in a config.py file
• sandbox.zarr was a poorly chosen name, rename it to manual_annotations.zarr. I have already made a copy in the S3 bucket of that file (so that now both sandbox.zarr.zip and manual_annotations.zarr.zip are present), so one needs just to adjust the notebooks.

Bắt đầu với các đường dẫn trong 00_xenium_and_visium.ipynb, 01_xenium_and_visium.ipynb và 02_xenium_and_visium.ipynb, sau đó xem xét config.py nên lưu trữ chúng như thế nào. Cập nhật các notebook để sử dụng manual_annotations.zarr thay cho sandbox.zarr và xác minh rằng tất cả các đường dẫn đều được tập trung hóa, đồng thời bản sao S3 đã được đổi tên được tham chiếu.