matplotlib / matplotlib/napari-matplotlib
HistogramWidget: 'MultiScaleData' object has no attribute 'ndim'
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Bug
- 主要言語
- Python
- スター
- 46
- フォーク
- 24
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
説明
Getting this error trying to use HistogramWidget with some zarr data loaded into napari:
File ~/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/napari_matplotlib/histogram.py:72, in HistogramWidget.draw(self=<napari_matplotlib.histogram.HistogramWidget object>)
67 """
68 Clear the axes and histogram the currently selected layer/slice.
69 """
70 layer = self.layers[0]
---> 72 if layer.data.ndim - layer.rgb == 3:
layer = <Image layer 'full_rebinned_4' at 0x16d1ad390>
layer.rgb = False
73 # 3D data, can be single channel or RGB
74 data = layer.data[self.current_z]
75 self.axes.set_title(f"z={self.current_z}")
AttributeError: 'MultiScaleData' object has no attribute 'ndim'
コントリビューションガイド
このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
調査の方向性
napari_matplotlib/histogram.py の HistogramWidget.draw から始め、特に layer.data.ndim にアクセスしている 72 行目を確認します。報告された zarr データを napari に読み込んでエラーを再現し、MultiScaleData がどのように widget に渡されるかを追跡します。HistogramWidget がこのデータを処理しても、報告された AttributeError が発生しなければ完了です。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
評価
- 技術スタック
- python
- 領域
- data-visualization
- issue の種類
- バグ
- 難易度
- 3/5
- 見積もり時間
- 1〜2日
- 活発さ
- 停滞
- 明瞭さ
- 説明が足りない
- 初心者へのやさしさ
- 30/100