matplotlib / matplotlib/napari-matplotlib

HistogramWidget: 'MultiScaleData' object has no attribute 'ndim'

オープン
#251 コメント 1 件 リアクション 0 件 担当者 0 名 GitHub で見る

まだ誰も着手していません。

Bug
主要言語
Python
スター
46
フォーク
24
PR マージ指標
30日以内にマージされた PR はありません

説明

Getting this error trying to use HistogramWidget with some zarr data loaded into napari:

File ~/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/napari_matplotlib/histogram.py:72, in HistogramWidget.draw(self=<napari_matplotlib.histogram.HistogramWidget object>)
     67 """
     68 Clear the axes and histogram the currently selected layer/slice.
     69 """
     70 layer = self.layers[0]
---> 72 if layer.data.ndim - layer.rgb == 3:
        layer = <Image layer 'full_rebinned_4' at 0x16d1ad390>
        layer.rgb = False
     73     # 3D data, can be single channel or RGB
     74     data = layer.data[self.current_z]
     75     self.axes.set_title(f"z={self.current_z}")

AttributeError: 'MultiScaleData' object has no attribute 'ndim'

コントリビューションガイド

このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません

はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

調査の方向性

napari_matplotlib/histogram.py の HistogramWidget.draw から始め、特に layer.data.ndim にアクセスしている 72 行目を確認します。報告された zarr データを napari に読み込んでエラーを再現し、MultiScaleData がどのように widget に渡されるかを追跡します。HistogramWidget がこのデータを処理しても、報告された AttributeError が発生しなければ完了です。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

評価

技術スタック
python
領域
data-visualization
issue の種類
バグ
難易度
3/5
見積もり時間
1〜2日
活発さ
停滞
明瞭さ
説明が足りない
初心者へのやさしさ
30/100

新しい issue をメールで受け取る

初心者向けの GitHub issue を短くまとめたダイジェスト。