matplotlib / matplotlib/napari-matplotlib
HistogramWidget: 'MultiScaleData' object has no attribute 'ndim'
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- Langage dominant
- Python
- Étoiles
- 46
- Forks
- 24
- Métriques de merge des PR
- Aucune PR mergée en 30 j
Description
Getting this error trying to use HistogramWidget with some zarr data loaded into napari:
File ~/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/napari_matplotlib/histogram.py:72, in HistogramWidget.draw(self=<napari_matplotlib.histogram.HistogramWidget object>)
67 """
68 Clear the axes and histogram the currently selected layer/slice.
69 """
70 layer = self.layers[0]
---> 72 if layer.data.ndim - layer.rgb == 3:
layer = <Image layer 'full_rebinned_4' at 0x16d1ad390>
layer.rgb = False
73 # 3D data, can be single channel or RGB
74 data = layer.data[self.current_z]
75 self.axes.set_title(f"z={self.current_z}")
AttributeError: 'MultiScaleData' object has no attribute 'ndim'
Guide de contribution
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Par où commencer
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Piste de recherche
Commencez dans napari_matplotlib/histogram.py, au niveau de HistogramWidget.draw, en particulier à la ligne 72 où layer.data.ndim est utilisé. Reproduisez l’erreur avec les données zarr signalées chargées dans napari et suivez la manière dont MultiScaleData est fourni au widget. La tâche est terminée lorsque HistogramWidget peut gérer ces données sans lever l’AttributeError signalée.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Évaluation
- Stack technique
- python
- Domaine
- data-visualization
- Type d'issue
- Bug
- Difficulté
- 3/5
- Temps estimé
- 1-2 jours
- Activité
- À l'abandon
- Clarté
- À clarifier
- Accessibilité débutants
- 30/100