matplotlib / matplotlib/napari-matplotlib
HistogramWidget: 'MultiScaleData' object has no attribute 'ndim'
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- Lenguaje dominante
- Python
- Estrellas
- 46
- Forks
- 24
- Métricas de merge de PR
- Sin PR fusionados en 30 d
Descripción
Getting this error trying to use `HistogramWidget` with some zarr data loaded into napari:
```python
File ~/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/napari_matplotlib/histogram.py:72, in HistogramWidget.draw(self=)
67 """
68 Clear the axes and histogram the currently selected layer/slice.
69 """
70 layer = self.layers[0]
---> 72 if layer.data.ndim - layer.rgb == 3:
layer =
layer.rgb = False
73 # 3D data, can be single channel or RGB
74 data = layer.data[self.current_z]
75 self.axes.set_title(f"z={self.current_z}")
AttributeError: 'MultiScaleData' object has no attribute 'ndim'
```
Guía de contribución
No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
Línea de trabajo
Comienza en napari_matplotlib/histogram.py, en HistogramWidget.draw, especialmente en la línea 72, donde se accede a layer.data.ndim. Reproduce el error con los datos zarr indicados cargados en napari y sigue cómo se proporciona MultiScaleData al widget. Se considera completado cuando HistogramWidget puede manejar estos datos sin generar el AttributeError indicado.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Evaluación
- Stack tecnológico
- python
- Área
- data-visualization
- Tipo de issue
- Error
- Dificultad
- 3/5
- Tiempo estimado
- 1-2 días
- Estado de actividad
- Estancado
- Claridad
- Necesita aclaración
- Aptitud para principiantes
- 30/100