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HistogramWidget: 'MultiScaleData' object has no attribute 'ndim'

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Bug
Lenguaje dominante
Python
Estrellas
46
Forks
24
Métricas de merge de PR
Sin PR fusionados en 30 d

Descripción

Getting this error trying to use `HistogramWidget` with some zarr data loaded into napari:

```python
File ~/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/napari_matplotlib/histogram.py:72, in HistogramWidget.draw(self=)
67 """
68 Clear the axes and histogram the currently selected layer/slice.
69 """
70 layer = self.layers[0]
---> 72 if layer.data.ndim - layer.rgb == 3:
layer =
layer.rgb = False
73 # 3D data, can be single channel or RGB
74 data = layer.data[self.current_z]
75 self.axes.set_title(f"z={self.current_z}")

AttributeError: 'MultiScaleData' object has no attribute 'ndim'
```

Guía de contribución

No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

Línea de trabajo

Comienza en napari_matplotlib/histogram.py, en HistogramWidget.draw, especialmente en la línea 72, donde se accede a layer.data.ndim. Reproduce el error con los datos zarr indicados cargados en napari y sigue cómo se proporciona MultiScaleData al widget. Se considera completado cuando HistogramWidget puede manejar estos datos sin generar el AttributeError indicado.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Evaluación

Stack tecnológico
python
Área
data-visualization
Tipo de issue
Error
Dificultad
3/5
Tiempo estimado
1-2 días
Estado de actividad
Estancado
Claridad
Necesita aclaración
Aptitud para principiantes
30/100

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