matplotlib / matplotlib/napari-matplotlib
HistogramWidget: 'MultiScaleData' object has no attribute 'ndim'
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Bug
- 主要语言
- Python
- 星标
- 46
- 派生
- 24
- PR 合并指标
- 30 天内没有已合并 PR
描述
Getting this error trying to use HistogramWidget with some zarr data loaded into napari:
File ~/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/napari_matplotlib/histogram.py:72, in HistogramWidget.draw(self=<napari_matplotlib.histogram.HistogramWidget object>)
67 """
68 Clear the axes and histogram the currently selected layer/slice.
69 """
70 layer = self.layers[0]
---> 72 if layer.data.ndim - layer.rgb == 3:
layer = <Image layer 'full_rebinned_4' at 0x16d1ad390>
layer.rgb = False
73 # 3D data, can be single channel or RGB
74 data = layer.data[self.current_z]
75 self.axes.set_title(f"z={self.current_z}")
AttributeError: 'MultiScaleData' object has no attribute 'ndim'
贡献指南
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调研方向
从 napari_matplotlib/histogram.py 中的 HistogramWidget.draw 开始,重点查看访问 layer.data.ndim 的第 72 行。将报告中的 zarr 数据加载到 napari 中以复现错误,并跟踪 MultiScaleData 如何提供给 widget。当 HistogramWidget 能够处理这些数据且不引发报告的 AttributeError 时,即表示完成。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
评估
- 技术栈
- python
- 领域
- data-visualization
- Issue 类型
- 缺陷
- 难度
- 3/5
- 预计耗时
- 1-2 天
- 活跃度
- 停滞
- 描述清晰度
- 需要澄清
- 新手友好度
- 30/100