matplotlib / matplotlib/napari-matplotlib
HistogramWidget: 'MultiScaleData' object has no attribute 'ndim'
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- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 46
- Fork
- 24
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Descrizione
Getting this error trying to use `HistogramWidget` with some zarr data loaded into napari:
```python
File ~/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/napari_matplotlib/histogram.py:72, in HistogramWidget.draw(self=)
67 """
68 Clear the axes and histogram the currently selected layer/slice.
69 """
70 layer = self.layers[0]
---> 72 if layer.data.ndim - layer.rgb == 3:
layer =
layer.rgb = False
73 # 3D data, can be single channel or RGB
74 data = layer.data[self.current_z]
75 self.axes.set_title(f"z={self.current_z}")
AttributeError: 'MultiScaleData' object has no attribute 'ndim'
```
Guida per i contributori
Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
Direzione di ricerca
Inizia in napari_matplotlib/histogram.py, in HistogramWidget.draw, soprattutto alla riga 72, dove si accede a layer.data.ndim. Riproduci l’errore con i dati zarr segnalati caricati in napari e traccia come MultiScaleData viene fornito al widget. Il lavoro è completato quando HistogramWidget riesce a gestire questi dati senza generare l’AttributeError riportato.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Valutazione
- Stack tecnologico
- python
- Ambito
- data-visualization
- Tipo di issue
- Bug
- Difficoltà
- 3/5
- Tempo stimato
- 1-2 giorni
- Stato di attività
- Ferma
- Chiarezza
- Da chiarire
- Idoneità per principianti
- 30/100