flake8 exclude list does not work

flake8 runs on files even if they are in the exclude list.

To reproduce:
1. Create a file called `.svn`.
2. Open it in Atom.
3. Change the grammar to MagicPython.
4. Type `1 + `.
5. Open the Linter pane and notice flake8 has raised W291 and E999.

Reproduziere das Problem in Atom, indem du eine `.svn`-Datei erstellst, MagicPython auswählst, `1 + ` eingibst und den Linter-Bereich überprüfst. Beginne damit nachzuverfolgen, wie flake8 die Ausschlussliste erhält; fertig ist es, wenn die dort aufgeführten Dateien nicht gelintet werden und die Meldungen W291 und E999 nicht mehr erscheinen.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.