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MONAI examples to imitate SynthSR and Synthseg in Freesurfer

Ouverte
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Langage dominant
Jupyter Notebook
Étoiles
2.5k
Forks
803
Merge moyen
6 j 22 h
PR mergées (30 j)
3

Description

Is your feature request related to a problem? Please describe.
I am looking for a tutorial for superresolution models with MONAI. That is models that can learn the mapping between

(1) low-resolution or low-quality (e.g., clinical scans) and (2) semantic segmentation maps (exact opposite of getting semantic segmentation from T1 scans)

with

high-quality scans.

These two requests have different utilities in practice.

There are prior implementations in Freesurfer but I do not know of any similar tutorial using MONAI.

Guide de contribution

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Par où commencer

  1. Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
  2. Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
  3. Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
  4. Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.

Piste de recherche

Commencez par examiner la référence SynthSR liée dans l’issue ainsi que le mappage demandé entre les scans de faible qualité, les scans de haute qualité et les cartes de segmentation sémantique. Le résultat attendu serait un tutoriel MONAI présentant le workflow de superrésolution demandé, mais l’issue n’identifie ni notebook cible, ni jeu de données, ni tests, ni point d’entrée spécifique.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Évaluation

Stack technique
jupyter-notebook, pytorch
Domaine
machine-learning
Type d'issue
Fonctionnalité
Difficulté
5/5
Temps estimé
Plus d'une semaine
Activité
À l'abandon
Clarté
À clarifier
Accessibilité débutants
30/100

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