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Project-MONAI

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MONAI
AI Toolkit for Healthcare Imaging

Python · 8696 étoiles
tutorials
MONAI Tutorials

Jupyter Notebook · 2549 étoiles
MONAILabel
MONAI Label is an intelligent open source image labeling and learning tool.

Python · 891 étoiles
model-zoo
MONAI Model Zoo that hosts models in the MONAI Bundle format.

Python · 339 étoiles
VISTA
MONAI Versatile Imaging Segmentation and Annotation

Python · 297 étoiles
monai-deploy-app-sdk
MONAI Deploy App SDK offers a framework and associated tools to design, develop and verify AI-driven applications in the healthcare imagi...

Python · 138 étoiles
MetricsReloaded

Python · 104 étoiles
project-monai.github.io
project monai website https://project-monai.github.io/

Astro · 9 étoiles
wg-ultrasound

Jupyter Notebook · 7 étoiles

Ouverte Toutes

Bug: need to specify hash_type='md5' in densenet_training_array.ipynb Ouverte

Difficulté 1/5 Moins d'une heure Accessibilité débutants 92/100

Project-MONAI/tutorials#2076 · Ouverte le 19/9/2026
Release 1.6.1 Checklist Ouverte

CI/CD

Project-MONAI/MONAI#9119 · 1 commentaire · 1 personne assignée · Ouverte le 17/9/2026
Add mindgrab skull-stripping bundle Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

Project-MONAI/model-zoo#786 · Ouverte le 16/9/2026
EmbeddingCollapseMetric: per-class rank scores never reach `aggregate`, so asymmetric collapse is invisible in the summary score Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 55/100

Project-MONAI/MONAI#9116 · Ouverte le 12/9/2026
DICOM slope/intercept rescale can silently leave float64 data, causing a hard crash at inference (no forced float32 cast anywhere in the SDK) Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 52/100

Project-MONAI/monai-deploy-app-sdk#592 · 1 commentaire · Ouverte le 11/9/2026
MonaiSegInferenceOperator: padding_mode='reflect' crashes on small (e.g. pediatric-scale) inputs Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 50/100

Project-MONAI/monai-deploy-app-sdk#591 · 1 commentaire · Ouverte le 11/9/2026
Support for YOLO-style / modern object detection models (2D and 3D) Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 30/100

Project-MONAI/MONAI#9111 · Ouverte le 11/9/2026
GridPatchDataset caching can repeat, drop, or reject samples Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 68/100

Project-MONAI/MONAI#9100 · Ouverte le 5/9/2026
HausdorffDistanceMetric percentile returns NaN for a missed prediction, dropping failures from the dataset average Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 52/100

Project-MONAI/MONAI#9095 · Ouverte le 4/9/2026
Tutorial proposal: complete AlbumentationsX augmentation pipeline for HoVerNet Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 62/100

Project-MONAI/tutorials#2071 · Ouverte le 2/9/2026
nuclick transforms: min_area and do_reconstruction are documented but never used Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 45/100

Project-MONAI/MONAI#9083 · 1 commentaire · Ouverte le 2/9/2026
replace monai.io in the tutorials Ouverte

Difficulté 1/5 1-3 heures Accessibilité débutants 76/100

Project-MONAI/tutorials#2069 · Ouverte le 27/8/2026
Expand ONNX export test coverage beyond UNet and SegResNet Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 75/100

Project-MONAI/MONAI#9072 · Ouverte le 25/8/2026
Unit-test results depend on the Python version: unbounded upper pins let 3.12 resolve dependencies CI never sees Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 55/100

Project-MONAI/MONAI#9069 · Ouverte le 22/8/2026
spatial_resample raises TypeError when spatial_size is None and spatial_rank is 1 Ouverte

Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 85/100

Project-MONAI/MONAI#9068 · 2 commentaires · Ouverte le 22/8/2026
Consolidate formatting: replace black and isort with ruff Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

Project-MONAI/MONAI#9066 · 1 commentaire · 3 réactions · Ouverte le 22/8/2026
get_edge_surface_distance passes the deprecated always_return_as_numpy argument internally Ouverte

Difficulté 1/5 1-3 heures Accessibilité débutants 55/100

Project-MONAI/MONAI#9059 · Ouverte le 17/8/2026
CI Updates 2026 Ouverte

CI/CD

Project-MONAI/MONAI#9058 · 2 personnes assignées · Ouverte le 12/8/2026
[Feature Request] Implement "Depth Reduced Strategy" for Model Compression across MONAI Networks Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 32/100

Project-MONAI/MONAI#9050 · 1 commentaire · Ouverte le 5/8/2026
CLAHE Transform Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 68/100

Project-MONAI/MONAI#9049 · 4 commentaires · Ouverte le 3/8/2026
RandGridPatch crashes for documented 0 or None patch_size entries Ouverte

Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 78/100

Project-MONAI/MONAI#9046 · Ouverte le 3/8/2026
Incorrect type hint in `pad_func` Ouverte

Difficulté 1/5 Moins d'une heure Accessibilité débutants 88/100

Project-MONAI/MONAI#9026 · Ouverte le 28/7/2026
[HAI] Challenge scoping for outreach (see #1905) Ouverte

Human-AI Interaction

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

Project-MONAI/MONAILabel#1906 · Ouverte le 27/7/2026
[HAI] General call for outreach ideas Ouverte

Human-AI Interaction

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 30/100

Project-MONAI/MONAILabel#1905 · Ouverte le 27/7/2026
Some Stored Weights for Bundles Not Compatible With `weights_only=True` Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 48/100

Project-MONAI/MONAI#9025 · 2 commentaires · Ouverte le 27/7/2026
GlobalMutualInformationLoss returns NaN for constant B-spline inputs Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 68/100

Project-MONAI/MONAI#9018 · Ouverte le 25/7/2026
Native transform for computing image registration (classical/instance-optimization) Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

Project-MONAI/MONAI#9008 · Ouverte le 22/7/2026
how to select valve segmentation in Auto3DSeg Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

Project-MONAI/tutorials#2067 · Ouverte le 20/7/2026
BoxToMaskD and MaskToBoxD Transpose Results Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 68/100

Project-MONAI/MONAI#8998 · 7 commentaires · Ouverte le 17/7/2026
Avoid shell=True in nnUNetV2Runner.train_parallel while preserving per-device command order Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 52/100

Project-MONAI/MONAI#8992 · 1 commentaire · Ouverte le 13/7/2026
Use Merge Queues Ouverte

CI/CD github_actions

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 48/100

Project-MONAI/MONAI#8990 · 3 commentaires · 2 réactions · Ouverte le 13/7/2026
CropForegroundd on ROI with text Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 38/100

Project-MONAI/MONAI#8988 · 1 commentaire · Ouverte le 9/7/2026
Skip CI Tests Based on Checks, Not Action File Ouverte

CI/CD Feedback welcomed

Project-MONAI/MONAI#8971 · 3 commentaires · 1 personne assignée · Ouverte le 2/7/2026
Candidate Duplicate Test Cases For Cleanup Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 50/100

Project-MONAI/MONAI#8942 · 2 commentaires · Ouverte le 22/6/2026
Feat Request: Conformal prediction Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 38/100

Project-MONAI/MONAI#8935 · 1 commentaire · Ouverte le 20/6/2026
[HAI] Persistent vs Sample Level Manifest protocol Ouverte

Human-AI Interaction

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

Project-MONAI/MONAILabel#1904 · Ouverte le 27/5/2026
Discussion: optional RankSEG-style decoding support in MONAI post-processing Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 30/100

Project-MONAI/MONAI#8857 · 3 commentaires · 7 réactions · Ouverte le 18/5/2026
[HAI] Wire protocol / API payload schema for label semantics Ouverte

Human-AI Interaction

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

Project-MONAI/MONAILabel#1903 · 5 commentaires · Ouverte le 13/5/2026
CI Error "OSError: [Errno 28] No space left on device" Ouverte

CI/CD

Project-MONAI/MONAI#8838 · 1 commentaire · 1 personne assignée · Ouverte le 29/4/2026
is this composition of transforms proper way of training a medical anatomy detection model using UNet ? Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 20/100

Project-MONAI/model-zoo#781 · 1 commentaire · Ouverte le 20/4/2026
https://ultrasound-open-access.nidusai.ca/ bugfixes Ouverte

bug data-and-tutorials

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 20/100

Project-MONAI/wg-ultrasound#12 · Ouverte le 15/4/2026
Support "Featured" Datasets Ouverte

data-and-tutorials

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 45/100

Project-MONAI/wg-ultrasound#11 · Ouverte le 15/4/2026
Add Data Snapshots for select datasets Ouverte

data-and-tutorials

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

Project-MONAI/wg-ultrasound#10 · Ouverte le 15/4/2026
https://github.com/open-h/OpenH-RF and https://ultrasound-open-access.nidusai.ca/ Ouverte

data-and-tutorials

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

Project-MONAI/wg-ultrasound#9 · Ouverte le 15/4/2026
[EHNANCEMENT] Better Performance For engines/utils.py Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

Project-MONAI/MONAI#8806 · 3 commentaires · Ouverte le 4/4/2026
Access Request: ADPKD Segmentation Model - UNIFESP Research Project Ouverte

Difficulté 1/5 Moins d'une heure Accessibilité débutants 25/100

Project-MONAI/model-zoo#780 · 1 commentaire · Ouverte le 4/4/2026
Application to the new scence Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

Project-MONAI/VISTA#69 · 2 commentaires · Ouverte le 3/4/2026
Clarification on [1] in swinunetr_pretrained README and training pipeline of ssl_pretrained_weights.pth Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 38/100

Project-MONAI/tutorials#2060 · Ouverte le 3/4/2026
oir_flatmount_segmentation - Hartnett lab model submission Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 52/100

Project-MONAI/model-zoo#777 · Ouverte le 25/3/2026
Reproduce issue with the inference.json Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100

Project-MONAI/VISTA#68 · 3 commentaires · Ouverte le 21/3/2026

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