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MONAI examples to imitate SynthSR and Synthseg in Freesurfer

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Lingua principale
Jupyter Notebook
Stelle
2.5k
Fork
803
Merge medio
6g 22h
PR unite (30g)
3

Descrizione

Is your feature request related to a problem? Please describe.
I am looking for a tutorial for superresolution models with MONAI. That is models that can learn the mapping between

(1) low-resolution or low-quality (e.g., clinical scans) and (2) semantic segmentation maps (exact opposite of getting semantic segmentation from T1 scans)

with

high-quality scans.

These two requests have different utilities in practice.

There are prior implementations in Freesurfer but I do not know of any similar tutorial using MONAI.

Guida per i contributori

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Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Direzione di ricerca

Inizia esaminando il riferimento SynthSR collegato nell’issue e la mappatura richiesta tra scansioni di bassa qualità, scansioni di alta qualità e mappe di segmentazione semantica. Il risultato dovrebbe essere un tutorial MONAI che dimostri il workflow di super-resolution richiesto, ma l’issue non identifica un notebook di destinazione, un dataset, test o uno specifico entry point.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Valutazione

Stack tecnologico
jupyter-notebook, pytorch
Ambito
machine-learning
Tipo di issue
Funzionalità
Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Stato di attività
Ferma
Chiarezza
Da chiarire
Idoneità per principianti
30/100

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