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MONAI examples to imitate SynthSR and Synthseg in Freesurfer

Offen
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Vorherrschende Sprache
Jupyter Notebook
Sterne
2.5k
Forks
803
Ø Merge
6 T. 22 Std.
Gemergte PRs (30 T.)
3

Beschreibung

Is your feature request related to a problem? Please describe.
I am looking for a tutorial for superresolution models with MONAI. That is models that can learn the mapping between

(1) low-resolution or low-quality (e.g., clinical scans) and (2) semantic segmentation maps (exact opposite of getting semantic segmentation from T1 scans)

with

high-quality scans.

These two requests have different utilities in practice.

There are prior implementations in Freesurfer but I do not know of any similar tutorial using MONAI.

Beitragsleitfaden

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Erste Schritte

  1. Lies das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreib ins Issue, dass du es übernimmst — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forke das Repository und arbeite in einem Branch.
  4. Öffne einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

Rechercherichtung

Beginne mit der Durchsicht der im Issue verlinkten SynthSR-Referenz und der angeforderten Zuordnung zwischen Scans niedriger Qualität, Scans hoher Qualität und semantischen Segmentierungskarten. Als Ergebnis wäre ein MONAI-Tutorial wünschenswert, das den angeforderten Superresolution-Workflow demonstriert; das Issue nennt jedoch kein Ziel-Notebook, keinen Datensatz, keine Tests und keinen spezifischen Einstiegspunkt.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Bewertung

Tech-Stack
jupyter-notebook, pytorch
Bereich
machine-learning
Issue-Typ
Feature
Schwierigkeit
5/5
Geschätzter Aufwand
Über eine Woche
Aktivitätsstatus
Veraltet
Klarheit
Muss geklärt werden
Anfängerfreundlichkeit
30/100

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