Propriétaire
PEtab-dev
6 dépôts indexés · Voir sur GitHub
-
PEtab
PEtab - an SBML and TSV based data format for parameter estimation problems in systems biology
66 étoiles
-
libpetab-python
Python package for working with PEtab files
Python · 18 étoiles
-
petab_select
Model selection for PEtab
Python · 14 étoiles
-
petab_sciml
Exchangeable data format for training Scientific Machine Learning (SciML) models
Python · 11 étoiles
-
petab_test_suite
PEtab test suite
Python · 6 étoiles
-
Julia · 0 étoiles
-
Improve model abstractions Ouverte
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
PEtab-dev/libpetab-python#518 ·
-
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100
PEtab-dev/petab_test_suite#117 ·
-
validation
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100
PEtab-dev/libpetab-python#494 · 1 commentaire ·
-
Linter Ouverte
PEtab-dev/petab_sciml#69 · 7 commentaires · 1 personne assignée ·
-
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 42/100
PEtab-dev/petab_sciml#66 ·
-
Add design principles page Ouverte
Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 38/100
PEtab-dev/petab_sciml#50 · 4 commentaires ·
-
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
-
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100
PEtab-dev/petab_test_suite#100 ·
-
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100
PEtab-dev/libpetab-python#466 ·
-
new test case v2
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100
-
v2
PEtab-dev/PEtab#653 · 3 commentaires · 1 réaction · 1 personne assignée ·
-
Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 25/100
PEtab-dev/petab_sciml#40 ·
-
enhancement
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100
PEtab-dev/libpetab-python#453 ·
-
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100
PEtab-dev/petab_select#163 ·
-
Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 45/100
PEtab-dev/petab_select#162 ·
-
documentation
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100
PEtab-dev/libpetab-python#439 ·
-
API for renaming PEtab entities Ouverteenhancement
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
PEtab-dev/libpetab-python#438 ·
-
Test suite TODO Ouverte
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 15/100
PEtab-dev/petab_sciml_testsuite#9 · 3 commentaires ·
-
Remove `v2.Problem.*_df` Ouverte
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100
PEtab-dev/libpetab-python#409 ·
-
v2: Add how-tos Ouvertedocumentation
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
-
v2: Visualization functions Ouverte
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
PEtab-dev/libpetab-python#398 ·
-
Document release process Ouvertedocumentation
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100
PEtab-dev/libpetab-python#396 ·
-
Documentation TODOs Ouverte
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 48/100
PEtab-dev/petab_sciml#23 · 1 commentaire ·
-
Subset priors Ouverte
PEtab-dev/petab_select#159 · 1 réaction · 1 personne assignée ·
-
v2: Handle multi-model problems Ouverte
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
PEtab-dev/libpetab-python#392 · 2 commentaires ·
-
Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 35/100
PEtab-dev/petab_select#158 ·
-
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100
-
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 15/100
PEtab-dev/petab_select#157 ·
-
Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 42/100
PEtab-dev/petab_select#156 ·
-
v2: Update validator Ouvertevalidation
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 30/100
PEtab-dev/libpetab-python#369 ·
-
Add CLI to docs Ouverte
Difficulté 1/5 Moins d'une heure Accessibilité débutants 45/100
PEtab-dev/petab_select#155 ·
-
Update README Ouverte
Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 45/100
PEtab-dev/petab_select#154 ·
-
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
PEtab-dev/petab_select#152 ·
-
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100
PEtab-dev/petab_select#133 ·
-
antlr runtime version Ouverte
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 42/100
PEtab-dev/libpetab-python#344 · 4 commentaires ·
-
PEtab SciML TODO Ouverte
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
PEtab-dev/petab_sciml#11 · 6 commentaires · 1 réaction ·
-
question v1
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 20/100
-
More introductory text in docs Ouvertefixed in next release
Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 35/100
PEtab-dev/petab_select#118 ·
-
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100
PEtab-dev/libpetab-python#314 ·
-
enhancement
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100
PEtab-dev/libpetab-python#312 · 2 réactions ·
-
Refactor priors Ouverteenhancement
PEtab-dev/libpetab-python#311 · 2 réactions · 1 personne assignée ·
-
PEtab-dev/libpetab-python#310 · 1 commentaire · 1 personne assignée ·
-
enhancement
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100
PEtab-dev/libpetab-python#305 · 2 réactions ·
-
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
PEtab-dev/libpetab-python#301 · 1 réaction ·
-
v2 validation: atomize checks Ouverte
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
PEtab-dev/libpetab-python#289 · 1 réaction ·
-
Integration of extensions Ouverte
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
PEtab-dev/libpetab-python#273 · 2 commentaires ·
-
Add test with multiple models Ouvertenew test case v2
Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
-
composite problem Ouverte
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100
PEtab-dev/libpetab-python#265 · 4 commentaires ·
-
new test case v1
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 25/100
-
bug visualization
Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100
PEtab-dev/libpetab-python#247 · 1 commentaire · 2 réactions ·