PEtab-dev / PEtab-dev/libpetab-python

v2: Handle multi-model problems

Ouverte
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Langage dominant
Python
Étoiles
18
Forks
9
Aucune PR mergée en 30 j

Description

PEtab v2 clarifies the semantics for using multiple models inside a single PEtab problem, see https://github.com/PEtab-dev/PEtab/pull/622/files. We need to adapt to that.

This requires:

  • #391
  • Multiple models inside Problem, or adding a CompositeProblem on top of Problem
  • Updating many validation rules
  • petab.v2.C.MODEL_ID
  • ...

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Par où commencer

  1. Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
  2. Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
  3. Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
  4. Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.

Piste de recherche

Start by reviewing the PEtab v2 semantics in the linked pull request #622 and the completed prerequisite #391. Then investigate how Problem currently represents models, whether a CompositeProblem is needed, and the validation rules affected. Done means supporting multiple models, updating the validations, and adding petab.v2.C.MODEL_ID.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Évaluation

Stack technique
python
Domaine
backend
Type d'issue
Fonctionnalité
Difficulté
5/5
Temps estimé
Plus d'une semaine
Activité
À l'abandon
Clarté
À clarifier
Accessibilité débutants
25/100

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