PEtab-dev / PEtab-dev/libpetab-python

v2: Handle multi-model problems

Aberta
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Linguagem predominante
Python
Estrelas
18
Forks
9
Métricas de merge de PRs
Nenhum PR com merge em 30d

Descrição

PEtab v2 clarifies the semantics for using multiple models inside a single PEtab problem, see https://github.com/PEtab-dev/PEtab/pull/622/files. We need to adapt to that.

This requires:

  • #391
  • Multiple models inside Problem, or adding a CompositeProblem on top of Problem
  • Updating many validation rules
  • petab.v2.C.MODEL_ID
  • ...

Guia de contribuição

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Primeiros passos

  1. Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
  2. Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
  3. Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
  4. Abra um pull request que referencie o número da issue.

Direção de pesquisa

Start by reviewing the PEtab v2 semantics in the linked pull request #622 and the completed prerequisite #391. Then investigate how Problem currently represents models, whether a CompositeProblem is needed, and the validation rules affected. Done means supporting multiple models, updating the validations, and adding petab.v2.C.MODEL_ID.

Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.

Avaliação

Stack de tecnologia
python
Domínio
backend
Tipo de issue
Funcionalidade
Dificuldade
5/5
Tempo estimado
Mais de uma semana
Status de atividade
Estagnada
Clareza
Precisa de esclarecimento
Facilidade para iniciantes
25/100

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