PEtab-dev / PEtab-dev/libpetab-python

v2: Handle multi-model problems

Offen
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Vorherrschende Sprache
Python
Sterne
18
Forks
9
Keine gemergten PRs in 30 T.

Beschreibung

PEtab v2 clarifies the semantics for using multiple models inside a single PEtab problem, see https://github.com/PEtab-dev/PEtab/pull/622/files. We need to adapt to that.

This requires:

  • #391
  • Multiple models inside Problem, or adding a CompositeProblem on top of Problem
  • Updating many validation rules
  • petab.v2.C.MODEL_ID
  • ...

Beitragsleitfaden

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Erste Schritte

  1. Lies das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreib ins Issue, dass du es übernimmst — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forke das Repository und arbeite in einem Branch.
  4. Öffne einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

Rechercherichtung

Start by reviewing the PEtab v2 semantics in the linked pull request #622 and the completed prerequisite #391. Then investigate how Problem currently represents models, whether a CompositeProblem is needed, and the validation rules affected. Done means supporting multiple models, updating the validations, and adding petab.v2.C.MODEL_ID.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Bewertung

Tech-Stack
python
Bereich
backend
Issue-Typ
Feature
Schwierigkeit
5/5
Geschätzter Aufwand
Über eine Woche
Aktivitätsstatus
Veraltet
Klarheit
Muss geklärt werden
Anfängerfreundlichkeit
25/100

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