PEtab-dev / PEtab-dev/libpetab-python

v2: Handle multi-model problems

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Lingua principale
Python
Stelle
18
Fork
9
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Descrizione

PEtab v2 clarifies the semantics for using multiple models inside a single PEtab problem, see https://github.com/PEtab-dev/PEtab/pull/622/files. We need to adapt to that.

This requires:

  • #391
  • Multiple models inside Problem, or adding a CompositeProblem on top of Problem
  • Updating many validation rules
  • petab.v2.C.MODEL_ID
  • ...

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Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Direzione di ricerca

Start by reviewing the PEtab v2 semantics in the linked pull request #622 and the completed prerequisite #391. Then investigate how Problem currently represents models, whether a CompositeProblem is needed, and the validation rules affected. Done means supporting multiple models, updating the validations, and adding petab.v2.C.MODEL_ID.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Valutazione

Stack tecnologico
python
Ambito
backend
Tipo di issue
Funzionalità
Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Stato di attività
Ferma
Chiarezza
Da chiarire
Idoneità per principianti
25/100

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