PEtab-dev / PEtab-dev/libpetab-python

Wrong plot_goodness_of_fit if different order of rows in measurement_df and simulation_df

Ouverte
#247 1 commentaire 2 réactions 0 personnes assignées Voir sur GitHub

Personne n'a encore pris cette issue.

bug visualization
Langage dominant
Python
Étoiles
18
Forks
9
Métriques de merge des PR
Aucune PR mergée en 30 j

Description

Currently there is no check in plot_goodness_of_fit that rows in measurement_df and simulation_df correspond to each other. And if they do not it messes up the plot.

For example, for the Isensee model from the benchmark collection

Wrong plot:
residuals_vs_simu

Correct plot:
residuals_vs_simu

Guide de contribution

Ouvrir le guide de contribution

Par où commencer

  1. Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
  2. Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
  3. Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
  4. Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.

Piste de recherche

Start by locating plot_goodness_of_fit and inspect how measurement_df and simulation_df rows are paired. Reproduce the Isensee benchmark example with differently ordered rows, then verify that the function detects or handles the mismatch so the resulting plot remains correct.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Évaluation

Stack technique
python
Domaine
data-visualization
Type d'issue
Bug
Difficulté
3/5
Temps estimé
1-2 jours
Activité
À l'abandon
Clarté
Plutôt claire
Accessibilité débutants
45/100

Recevez les nouvelles issues par e-mail

Un résumé court des issues GitHub adaptées aux débutants.