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v2: Update validator

Aberta
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validation
Linguagem predominante
Python
Estrelas
18
Forks
9
Métricas de merge de PRs
Nenhum PR com merge em 30d

Descrição

So far, validation in petab.v2 is too lax and validator errors aren't too pretty and are often truncated.

  • Readable error message
  • include sufficient context in error messages
  • Check for missing columns in files
  • Consider using strict mode for validating files, but be more relaxed when programmatically constructing PEtab objects
  • Decide whether we need to be able to de-serialize (somewhat) incorrect PEtab problems

Guia de contribuição

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Primeiros passos

  1. Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
  2. Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
  3. Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
  4. Abra um pull request que referencie o número da issue.

Direção de pesquisa

The issue identifies validation in petab.v2 but names no files or tests. Start by locating the v2 validator and its validation tests, then separate missing-column checks from the strict-mode and deserialization decisions. Done requires an agreed scope and completion of the selected checklist items without truncated or context-poor errors.

Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.

Avaliação

Stack de tecnologia
python
Domínio
backend, testing-qa
Tipo de issue
Funcionalidade
Dificuldade
5/5
Tempo estimado
Mais de uma semana
Status de atividade
Estagnada
Clareza
Precisa de esclarecimento
Facilidade para iniciantes
30/100

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