PEtab-dev / PEtab-dev/libpetab-python
v2: Update validator
Aperta
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validation
- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 18
- Fork
- 9
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Descrizione
So far, validation in petab.v2 is too lax and validator errors aren't too pretty and are often truncated.
- Readable error message
- include sufficient context in error messages
- Check for missing columns in files
- Consider using strict mode for validating files, but be more relaxed when programmatically constructing PEtab objects
- Decide whether we need to be able to de-serialize (somewhat) incorrect PEtab problems
Guida per i contributori
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Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
Direzione di ricerca
The issue identifies validation in petab.v2 but names no files or tests. Start by locating the v2 validator and its validation tests, then separate missing-column checks from the strict-mode and deserialization decisions. Done requires an agreed scope and completion of the selected checklist items without truncated or context-poor errors.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Valutazione
- Stack tecnologico
- python
- Ambito
- backend, testing-qa
- Tipo di issue
- Funzionalità
- Difficoltà
- 5/5
- Tempo stimato
- Più di una settimana
- Stato di attività
- Ferma
- Chiarezza
- Da chiarire
- Idoneità per principianti
- 30/100