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v2: Update validator

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validation
主要語言
Python
星號
18
分支
9
PR 合併指標
30 天內沒有已合併 PR

描述

So far, validation in petab.v2 is too lax and validator errors aren't too pretty and are often truncated.

  • Readable error message
  • include sufficient context in error messages
  • Check for missing columns in files
  • Consider using strict mode for validating files, but be more relaxed when programmatically constructing PEtab objects
  • Decide whether we need to be able to de-serialize (somewhat) incorrect PEtab problems

貢獻指南

開啟貢獻指南

從這裡開始

  1. 先讀完整個 Issue,再讀專案的貢獻指南。
  2. 在 Issue 下留言說明你要接手 —— 這能避免兩個人做同樣的事。
  3. Fork 儲存庫,在一個分支上完成修改。
  4. 送出 Pull Request,並在描述裡引用這個 Issue 編號。

研究方向

The issue identifies validation in petab.v2 but names no files or tests. Start by locating the v2 validator and its validation tests, then separate missing-column checks from the strict-mode and deserialization decisions. Done requires an agreed scope and completion of the selected checklist items without truncated or context-poor errors.

由索引模型根據 Issue 內容生成。

評估

技術堆疊
python
領域
backend, testing-qa
Issue 類型
功能
難度
5/5
預估耗時
一週以上
活躍度
停滯
描述清晰度
需要釐清
新手友好度
30/100

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