PEtab-dev / PEtab-dev/libpetab-python
v2: Update validator
Offen
Dieses Issue hat noch niemand übernommen.
validation
- Vorherrschende Sprache
- Python
- Sterne
- 18
- Forks
- 9
- PR-Merge-Kennzahlen
- Keine gemergten PRs in 30 T.
Beschreibung
So far, validation in petab.v2 is too lax and validator errors aren't too pretty and are often truncated.
- Readable error message
- include sufficient context in error messages
- Check for missing columns in files
- Consider using strict mode for validating files, but be more relaxed when programmatically constructing PEtab objects
- Decide whether we need to be able to de-serialize (somewhat) incorrect PEtab problems
Beitragsleitfaden
Erste Schritte
- Lies das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
- Schreib ins Issue, dass du es übernimmst — das erspart doppelte Arbeit.
- Forke das Repository und arbeite in einem Branch.
- Öffne einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.
Rechercherichtung
The issue identifies validation in petab.v2 but names no files or tests. Start by locating the v2 validator and its validation tests, then separate missing-column checks from the strict-mode and deserialization decisions. Done requires an agreed scope and completion of the selected checklist items without truncated or context-poor errors.
Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.
Bewertung
- Tech-Stack
- python
- Bereich
- backend, testing-qa
- Issue-Typ
- Feature
- Schwierigkeit
- 5/5
- Geschätzter Aufwand
- Über eine Woche
- Aktivitätsstatus
- Veraltet
- Klarheit
- Muss geklärt werden
- Anfängerfreundlichkeit
- 30/100