OpenFreeEnergy / OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks
Merge cinnabar-absolute and cinnabar RBFE plotting docs
Chưa có ai nhận issue này.
- Ngôn ngữ chính
- Jupyter Notebook
- Star
- 70
- Fork
- 15
- Merge trung bình
- 10 giờ 42 phút
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 2
Mô tả
https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/cookbook/cinnabar_absolute.ipynb is currently not used in the openfe docs, we should merge it into https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb to make a general plotting with cinnabar notebook with sections for RBFE and ABFE result plotting starting from outputs from the openfe CLI.
Hướng dẫn đóng góp
Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Hướng nghiên cứu
So sánh cinnabar_absolute.ipynb với plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb, bắt đầu bằng việc đọc luồng của cả hai notebook và cách chúng sử dụng đầu ra từ openfe CLI. Kết hợp chúng thành một notebook vẽ biểu đồ Cinnabar tổng quát với các phần riêng biệt cho RBFE và ABFE, sau đó xác minh rằng cả hai loại kết quả đều được bao quát và notebook phù hợp với tài liệu openfe.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Đánh giá
- Công nghệ
- jupyter-notebook
- Lĩnh vực
- cli, documentation
- Loại issue
- Tài liệu
- Độ khó
- 3/5
- Thời gian dự kiến
- 1-2 ngày
- Mức độ hoạt động
- Ít trao đổi
- Độ rõ ràng
- Khá rõ ràng
- Mức phù hợp với người mới
- 68/100