OpenFreeEnergy / OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks
Merge cinnabar-absolute and cinnabar RBFE plotting docs
まだ誰も着手していません。
- 主要言語
- Jupyter Notebook
- スター
- 70
- フォーク
- 15
- 平均マージ
- 10時間 42分
- マージ済み PR（30日）
- 2
説明
https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/cookbook/cinnabar_absolute.ipynb is currently not used in the openfe docs, we should merge it into https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb to make a general plotting with cinnabar notebook with sections for RBFE and ABFE result plotting starting from outputs from the openfe CLI.
コントリビューションガイド
このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
調査の方向性
cinnabar_absolute.ipynb と plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb を比較し、まず両方の notebook のフローと、openfe CLI の出力をどのように利用しているかを読み取ります。それらを、RBFE と ABFE のセクションを分けた、Cinnabar 用の汎用的なプロット notebook に統合します。その後、両方の結果タイプがカバーされていること、および notebook が openfe のドキュメントに適していることを確認します。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
評価
- 技術スタック
- jupyter-notebook
- 領域
- cli, documentation
- issue の種類
- ドキュメント
- 難易度
- 3/5
- 見積もり時間
- 1〜2日
- 活発さ
- 静か
- 明瞭さ
- おおむね明確
- 初心者へのやさしさ
- 68/100