OpenFreeEnergy / OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks
Merge cinnabar-absolute and cinnabar RBFE plotting docs
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- Lenguaje dominante
- Jupyter Notebook
- Estrellas
- 70
- Forks
- 15
- Merge medio
- 10 h 42 min
- PR fusionados (30 d)
- 2
Descripción
https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/cookbook/cinnabar_absolute.ipynb is currently not used in the openfe docs, we should merge it into https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb to make a general plotting with cinnabar notebook with sections for RBFE and ABFE result plotting starting from outputs from the openfe CLI.
Guía de contribución
No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
Línea de trabajo
Compara cinnabar_absolute.ipynb con plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb, empezando por leer los flujos de ambos notebooks y cómo consumen las salidas de la openfe CLI. Combínalos en un notebook general de visualización con Cinnabar, con secciones diferenciadas para RBFE y ABFE, y después verifica que ambos tipos de resultados estén cubiertos y que el notebook sea adecuado para la documentación de openfe.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Evaluación
- Stack tecnológico
- jupyter-notebook
- Área
- cli, documentation
- Tipo de issue
- Documentación
- Dificultad
- 3/5
- Tiempo estimado
- 1-2 días
- Estado de actividad
- Tranquilo
- Claridad
- Bastante claro
- Aptitud para principiantes
- 68/100