OpenFreeEnergy / OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks
Merge cinnabar-absolute and cinnabar RBFE plotting docs
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- Langage dominant
- Jupyter Notebook
- Étoiles
- 70
- Forks
- 15
- Merge moyen
- 10 h 42 min
- PR mergées (30 j)
- 2
Description
https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/cookbook/cinnabar_absolute.ipynb is currently not used in the openfe docs, we should merge it into https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb to make a general plotting with cinnabar notebook with sections for RBFE and ABFE result plotting starting from outputs from the openfe CLI.
Guide de contribution
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Piste de recherche
Comparez cinnabar_absolute.ipynb avec plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb, en commençant par lire le déroulement des deux notebooks et la manière dont ils utilisent les sorties de la openfe CLI. Combinez-les en un notebook général de visualisation avec Cinnabar, avec des sections distinctes pour RBFE et ABFE, puis vérifiez que les deux types de résultats sont couverts et que le notebook convient à la documentation openfe.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Évaluation
- Stack technique
- jupyter-notebook
- Domaine
- cli, documentation
- Type d'issue
- Documentation
- Difficulté
- 3/5
- Temps estimé
- 1-2 jours
- Activité
- Calme
- Clarté
- Plutôt claire
- Accessibilité débutants
- 68/100