OpenFreeEnergy / OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks
Merge cinnabar-absolute and cinnabar RBFE plotting docs
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- 主要语言
- Jupyter Notebook
- 星标
- 70
- 派生
- 15
- 平均合并
- 10 小时 42 分钟
- 30 天内合并 PR
- 2
描述
https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/cookbook/cinnabar_absolute.ipynb is currently not used in the openfe docs, we should merge it into https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb to make a general plotting with cinnabar notebook with sections for RBFE and ABFE result plotting starting from outputs from the openfe CLI.
贡献指南
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调研方向
比较 cinnabar_absolute.ipynb 和 plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb，首先阅读两个 notebook 的流程，以及它们如何使用 openfe CLI 的输出。将它们合并为一个通用的 Cinnabar 绘图 notebook，其中包含独立的 RBFE 和 ABFE 部分，然后验证两种结果类型都已涵盖，并确认该 notebook 适合用于 openfe 文档。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
评估
- 技术栈
- jupyter-notebook
- 领域
- cli, documentation
- Issue 类型
- 文档
- 难度
- 3/5
- 预计耗时
- 1-2 天
- 活跃度
- 冷清
- 描述清晰度
- 基本清楚
- 新手友好度
- 68/100