MetaCell / MetaCell/NetPyNE-UI

Add option for display/editing of cell list

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enhancement
Langage dominant
JavaScript
Étoiles
23
Forks
10
Métriques de merge des PR
Aucune PR mergée en 30 j

Description

Specifying a list of cell positions is a standard feature of NetPyNE populations, and will be crucial for loading/displaying NeuroML models, where the positions are generated in NeuroML (e.g. with pyNeuroML or NeuroMLlite) and exported to NetPyNE using "cellsList" in the popParams element, e.g. https://github.com/OpenSourceBrain/NetPyNEShowcase/blob/0fa6c7032d9b2984f169d48773e573e16b9a8505/NetPyNE/UI/HHCellNetwork.txt.json#L99.

However this is not curently supported by the UI. The cellList etc. is probably loaded in the background by netpyne core, and possibly used for generation (although possibly not, see https://github.com/MetaCell/NetPyNE-UI/issues/213), but the user can't see this. Adding this feature in the UI will make NML imported models (and an other models that use cellList) more transparent & reproducible.

Screenshot 2021-02-24 at 12 24 42

Guide de contribution

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Piste de recherche

Commencez par retracer la manière dont NetPyNE-UI charge et modifie les paramètres de population, en particulier le champ cellsList dans popParams. Examinez l’issue #213 et l’exemple NetPyNEShowcase associé pour comprendre si la liste est seulement chargée ou si elle est également utilisée lors de la génération. La tâche est considérée comme terminée lorsque les utilisateurs peuvent voir et modifier les positions des cellules dans l’UI et que les valeurs restent transparentes et reproductibles pour les modèles NeuroML importés.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Évaluation

Stack technique
javascript
Domaine
frontend
Type d'issue
Fonctionnalité
Difficulté
4/5
Temps estimé
3-5 jours
Activité
À l'abandon
Clarté
Plutôt claire
Accessibilité débutants
38/100

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