AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper

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Repository to help gather and map metadata from different sources

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已索引 issue: 37
平均合并: 1 天 7 小时
30 天内合并 PR: 1

主要语言: Python
许可证: MIT
最近 GitHub push: 2026年9月11日
最近索引: 2026年9月13日
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目前已索引 36 个未关闭的 Issue

Extract metadata from mesoscope rig acquisition files 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#24 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Stimulus epoch generation for multiplane ophys sessions 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#89 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 2 人 · 索引于 2026年9月13日
example script for U19 ETL 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#94 · 2 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Optimize Integration Tests 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#107 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Integration test for Bruker package 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#108 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Integration Test for FIP package 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#109 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Add Rewards Behavior to stim epochs based on Saskia's Feedback 未关闭

enhancement

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#150 · 3 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Add CamstimEphysEtl to Gather Metadata 未关闭

question

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#176 · 2 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Create timestamps.npy file for unaligned data 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#180 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Remove ml and ap fov coords from mesoscope session object 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#197 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Power in mW to the session.json 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#224 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Behavior stimulus table should include passive time period 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#243 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Installation fails on macOS with Python 3.13 due to wavpack-numcodecs compatibility 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#261 · 2 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Add support for Python 3.12 and 3.13 testing 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#263 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
fix: photostimulation trials mislabeled as spontaneous 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#295 · 2 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 2 人 · 索引于 2026年9月13日
Add support for optogenetic FIP sessions and improve file pattern detection 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#298 · 3 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Add session_type to Bergamo session model 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#299 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Add stimulus epoch for bci single neuron stim control 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#306 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Define datasets for integration testing of metadata mapper 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#308 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Add a new behavior type for Bergamo 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#309 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Modify mesoscope metadata mapper for deepdive data 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#320 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Port pavlovian behavior extractor to aind-metadata-extractor 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#331 · 5 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Port open ephys extractor to aind-metadata-extractor 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#332 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Port dynamic routing extractor to aind-metadata-extractor 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#335 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Port bruker extractor to aind-metadata-extractor 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#336 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Update SmartSPIM acquisition to accommodate laser calibration 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#343 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
multiplane-ophys QC z-drift local stack 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#370 · 4 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Add laser power mapping for each mesoscope plane 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#372 · 3 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Add functionality to ingest extracted output from Opto Fiber Benchmark epxerimental workflow and pass to mapper 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#410 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Update fip mapper to use `acquisition_type` 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#414 · 2 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Update FIP mapper to use passed patch_cable to fiber connection info 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#416 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Multiplane-ophys V2: Map the mesoscope extracted data to an acquisition file 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#438 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
GatherMetadataJob should accept multiple instrument_ids and ensure alphabetical order when merging 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#448 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
GathereMetadataJob should automatically populate curriculum fields in StimulusEpoch 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#465 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
GatherMetadataJob should raise an error when subject.sex or subject.genotype are null 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#479 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
BaseMapper incorrectly cited in readme 未关闭

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#483 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日

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