AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper

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Repository to help gather and map metadata from different sources

Étoiles: 0
Forks: 2
Issues débutants ouvertes: 0
Issues indexées: 37
Merge moyen: 1 j 7 h
PR mergées (30 j): 1

Langage dominant: Python
Licence: MIT
Dernier push GitHub: 11/9/2026
Dernière indexation: 13/9/2026
Guide de contribution: Guide de contribution
Code de conduite: Code de conduite
Labels débutants: Aucun label débutant indexé

Ouverte Toutes

36 issues ouvertes indexées

Extract metadata from mesoscope rig acquisition files Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#24 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Stimulus epoch generation for multiplane ophys sessions Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#89 · 0 commentaires · 0 réactions · 2 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
example script for U19 ETL Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#94 · 2 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Optimize Integration Tests Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#107 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Integration test for Bruker package Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#108 · 1 commentaire · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Integration Test for FIP package Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#109 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Add Rewards Behavior to stim epochs based on Saskia's Feedback Ouverte

enhancement

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#150 · 3 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Add CamstimEphysEtl to Gather Metadata Ouverte

question

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#176 · 2 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Create timestamps.npy file for unaligned data Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#180 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Remove ml and ap fov coords from mesoscope session object Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#197 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Power in mW to the session.json Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#224 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Behavior stimulus table should include passive time period Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#243 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Installation fails on macOS with Python 3.13 due to wavpack-numcodecs compatibility Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#261 · 2 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Add support for Python 3.12 and 3.13 testing Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#263 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
fix: photostimulation trials mislabeled as spontaneous Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#295 · 2 commentaires · 0 réactions · 2 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Add support for optogenetic FIP sessions and improve file pattern detection Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#298 · 3 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Add session_type to Bergamo session model Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#299 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Add stimulus epoch for bci single neuron stim control Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#306 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Define datasets for integration testing of metadata mapper Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#308 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Add a new behavior type for Bergamo Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#309 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Modify mesoscope metadata mapper for deepdive data Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#320 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Port pavlovian behavior extractor to aind-metadata-extractor Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#331 · 5 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Port open ephys extractor to aind-metadata-extractor Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#332 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Port dynamic routing extractor to aind-metadata-extractor Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#335 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Port bruker extractor to aind-metadata-extractor Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#336 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Update SmartSPIM acquisition to accommodate laser calibration Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#343 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
multiplane-ophys QC z-drift local stack Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#370 · 4 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Add laser power mapping for each mesoscope plane Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#372 · 3 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Add functionality to ingest extracted output from Opto Fiber Benchmark epxerimental workflow and pass to mapper Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#410 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Update fip mapper to use `acquisition_type` Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#414 · 2 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Update FIP mapper to use passed patch_cable to fiber connection info Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#416 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Multiplane-ophys V2: Map the mesoscope extracted data to an acquisition file Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#438 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
GatherMetadataJob should accept multiple instrument_ids and ensure alphabetical order when merging Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#448 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
GathereMetadataJob should automatically populate curriculum fields in StimulusEpoch Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#465 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
GatherMetadataJob should raise an error when subject.sex or subject.genotype are null Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#479 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
BaseMapper incorrectly cited in readme Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#483 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper

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