AllenNeuralDynamics

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper

Ver en GitHub

Repository to help gather and map metadata from different sources

Estrellas: 0
Forks: 2
Issues abiertos para principiantes: 0
Issues indexados: 37
Merge medio: 1 d 7 h
PR fusionados (30 d): 1

Lenguaje dominante: Python
Licencia: MIT
Último push a GitHub: 11/9/2026
Última indexación: 13/9/2026
Guía de contribución: Guía de contribución
Código de conducta: Código de conducta
Etiquetas para principiantes: Sin etiquetas para principiantes indexadas

Abierto Todos

36 issues abiertos indexados

Extract metadata from mesoscope rig acquisition files Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#24 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Stimulus epoch generation for multiplane ophys sessions Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#89 · 0 comentarios · 0 reacciones · 2 asignados · Indexado el 13/9/2026
example script for U19 ETL Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#94 · 2 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Optimize Integration Tests Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#107 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Integration test for Bruker package Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#108 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Integration Test for FIP package Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#109 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Add Rewards Behavior to stim epochs based on Saskia's Feedback Abierto

enhancement

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#150 · 3 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Add CamstimEphysEtl to Gather Metadata Abierto

question

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#176 · 2 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Create timestamps.npy file for unaligned data Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#180 · 1 comentario · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Remove ml and ap fov coords from mesoscope session object Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#197 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Power in mW to the session.json Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#224 · 1 comentario · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Behavior stimulus table should include passive time period Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#243 · 1 comentario · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Installation fails on macOS with Python 3.13 due to wavpack-numcodecs compatibility Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#261 · 2 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Add support for Python 3.12 and 3.13 testing Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#263 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
fix: photostimulation trials mislabeled as spontaneous Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#295 · 2 comentarios · 0 reacciones · 2 asignados · Indexado el 13/9/2026
Add support for optogenetic FIP sessions and improve file pattern detection Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#298 · 3 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Add session_type to Bergamo session model Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#299 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Add stimulus epoch for bci single neuron stim control Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#306 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Define datasets for integration testing of metadata mapper Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#308 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Add a new behavior type for Bergamo Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#309 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Modify mesoscope metadata mapper for deepdive data Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#320 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Port pavlovian behavior extractor to aind-metadata-extractor Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#331 · 5 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Port open ephys extractor to aind-metadata-extractor Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#332 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Port dynamic routing extractor to aind-metadata-extractor Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#335 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Port bruker extractor to aind-metadata-extractor Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#336 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Update SmartSPIM acquisition to accommodate laser calibration Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#343 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
multiplane-ophys QC z-drift local stack Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#370 · 4 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Add laser power mapping for each mesoscope plane Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#372 · 3 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Add functionality to ingest extracted output from Opto Fiber Benchmark epxerimental workflow and pass to mapper Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#410 · 1 comentario · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Update fip mapper to use `acquisition_type` Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#414 · 2 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Update FIP mapper to use passed patch_cable to fiber connection info Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#416 · 1 comentario · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Multiplane-ophys V2: Map the mesoscope extracted data to an acquisition file Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#438 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
GatherMetadataJob should accept multiple instrument_ids and ensure alphabetical order when merging Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#448 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
GathereMetadataJob should automatically populate curriculum fields in StimulusEpoch Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#465 · 1 comentario · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
GatherMetadataJob should raise an error when subject.sex or subject.genotype are null Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#479 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
BaseMapper incorrectly cited in readme Abierto

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#483 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026

Un resumen breve de issues de GitHub para principiantes.